Il Convento di San Francesco, situato poco fuori da Cittadella, venne fondato nel 1481. Nel 1509 il complesso venne completamente distrutto a seguito della guerra di Cambrai e fu ricostruito poco più di dieci anni più tardi. Nel 1545 fu abbandonato, a favore del vicino monastero di Santa Croce Bigolina, poiché il Comune di Cittadella non era in grado di farsi carico delle spese di mantenimento di entrambi. Nel corso dei secoli successivi, fu interessato da numerosi lavori di ampliamento e restauro.
A inizi ‘800 e per quasi un secolo, il convento fu utilizzato come caserma, per tornare a essere adibito all’originaria funzione solo nel 1944. Il complesso comprende una semplice chiesa a navata unica, dotata di tre altari, e un convento con chiostro porticato.