Una prima chiesa venne edificata nell’area dei mulini attorno al 1260, per volere di alcune famiglie che si erano distaccate da Cervarese Santa Croce, dando così vita alla comunità di Cervarese Santa Maria. L’edificio originario subì per secoli i danneggiamenti causati dalle esondazioni del vicino corso fluviale, fino a quando il governo austriaco iniziò i lavori di costruzione dell’attuale chiesa.
Il dipinto raffigurante la Natività di Maria, posto dietro l’altare maggiore e opera del Pellizzari, risale alla metà del XVII secolo.